Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms