Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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NCAPHQ15003 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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