Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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