Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MELKQ14680 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MELKQ14680 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MELKQ14680 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MELKQ14680 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MELKQ14680 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MELKQ14680 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MELKQ14680 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MELKQ14680 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MELKQ14680 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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