Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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