Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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