Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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