Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms