Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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