Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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