Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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