Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms