Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME3Q13232 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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