Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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