Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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