Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNA1Q09470 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms