Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms