Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms