Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms