Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms