Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms