Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms