Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIM1P81133 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIM1P81133 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIM1P81133 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIM1P81133 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms