Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms