Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms