Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms