Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms