Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1P60507 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms