Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms