Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms