Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXNP49023 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXNP49023 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXNP49023 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXNP49023 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXNP49023 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXNP49023 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXNP49023 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXNP49023 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXNP49023 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXNP49023 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms