Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA4P48169 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms