Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTRNP46939 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTRNP46939 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms