Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGER3P43115 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms