Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms