Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM23P36406 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms