Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCGF2P35227 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms