Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms