Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA6P31267 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms