Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF1P30408 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms