Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC27P30260 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC27P30260 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms