Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms