Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
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