Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYF6P23409 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYF6P23409 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYF6P23409 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MYF6P23409 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms