Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA6P23229 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms