Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALB2P22676 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALB2P22676 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALB2P22676 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALB2P22676 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALB2P22676 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms