Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT1P21579 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT1P21579 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT1P21579 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT1P21579 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT1P21579 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT1P21579 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT1P21579 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms