Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms