Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms