Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LIG1P18858 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIG1P18858 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
LIG1P18858 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LIG1P18858 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIG1P18858 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIG1P18858 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms